反对长期服用避孕药的医师，认为这种外来的荷尔蒙控制方式，或多或少会影响身体机能。临床研究已经发现，避孕药容易导致中风或乳疾病的後遗症；但是这些医师也承认，发生机率实在相当低。

建议长期服用避孕药，甚至把避孕药用来治疗其他疾病症状的医师，则是强调荷尔蒙疗法的功效值得肯定；而且，女性生理期对女人的影响，其实已经被过度强调。

生育虽然是女人的天职，但却不是女人必须要承担的责任。因此利用避孕药帮助女性控制生理期，不但有其必要，也可让女人拥有真正的身体自主权。

但是让美国食品药物管理局真正担心的是：越来越多医师以非经ＦＤＡ核可的疗效治疗病人，这才是真正让人担忧避孕药副作用的根源。

如何预防避孕药的副作用伤害身体呢？ＦＤＡ的建议是：

1.与主治的妇产科医师密切配合，让医师替你处方避孕药。

2.即使服用避孕药期间没有任何问题，也应该定期检查身体。